MISA eSign cung cấp chữ ký số từ xa (không cần thiết bị USB Token vật lý) chia theo 3 nhóm đối tượng: Tổ chức, Cá nhân và Cá nhân trong tổ chức. Gói cá nhân có giá thấp nhất từ 220.000đ/năm cho ký không giới hạn; ngoài ra còn có gói theo tháng (từ 20.000đ/tháng cho 10 lượt ký đến 35.000đ/tháng không giới hạn).
Gói dành cho Tổ chức là gói "Mua 1 Được 2" kết hợp cả chữ ký số từ xa và USB Token: 1 năm giá 2.400.000đ, 3 năm giá 4.400.000đ (tiết kiệm khoảng 30% so với mua từng năm). Gói cho Hộ kinh doanh khởi điểm 550.000đ/năm, có gói dài hạn 5 năm giá 1.850.000đ. Ngoài ra còn gói cao cấp dành cho doanh nghiệp có nhu cầu ký khối lượng lớn (y tế, ngân hàng, xăng dầu...) từ 3.900.000đ/năm.
Theo công bố của nhà cung cấp, dịch vụ chữ ký số MISA eSign không chịu thuế VAT nên khách hàng không phải trả thêm khoản này.